有机态氮的矿化作用是制有机态氮如蛋白质在微生物分泌的酶作用下水解为氨基酸，再分解为氨，最终的产物是氨，也称氨化作用。当有机物质C/N比例低于25时，会有氨释放出来；如果有机物质的C/N比例高于30，有机物质中所有的氮素都将用于组建微生物的躯体，不仅没有任何氮素释放出来，而且还从土壤中吸收无机氮，这就是土壤氮素的微生物固定，或称生物固定。